Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDGFRLQ15198 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms