Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RUNX2Q13950 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RUNX2Q13950 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms