Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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