Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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