Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.56
PTP4A2Q12974 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms