Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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PTPRBP23467 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRBP23467 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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