Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ZBED1O96006 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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