Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms