Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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