Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RUNX3Q13761 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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