Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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IFT88Q13099 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
IFT88Q13099 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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