Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SLFN12-202ENST00000394562 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 STXBP5L-206ENST00000492541 3114 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 WDR11-AS1-203ENST00000598981 2242 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL365356.3-201ENST00000427341 657 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CEACAM22P-201ENST00000446628 3016 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL845331.3-201ENST00000562821 2028 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms