Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC108463.3-201ENST00000603748 1482 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GNRHR2-202ENST00000361928 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RABL2A-201ENST00000376439 623 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079779.2-202ENST00000427831 392 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC244034.1-201ENST00000428027 792 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL380P-201ENST00000461702 308 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 C6orf229-201ENST00000565469 814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC008687.3-201ENST00000599209 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC131025.2-201ENST00000622374 422 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP003108.5-201ENST00000623008 895 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-228ENST00000633402 565 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FAAHP1-207ENST00000635606 398 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms