Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CTF1Q16619 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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