Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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