Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HTR4Q13639 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms