Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CUL3Q13618 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms