Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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TOP3AQ13472 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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