Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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