Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms