Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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