Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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