Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms