Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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