Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms