Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms