Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB6CQ53S08 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms