Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms