Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms