Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms