Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NFIXQ14938 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms