Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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