Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
MKRN4PQ13434 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 RN7SL63P-201ENST00000468228 304 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 ATP5A1P3-201ENST00000573189 1507 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 PACRG-201ENST00000337019 1619 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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