Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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