Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CEACAM8-201ENST00000244336 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 GRIA3-209ENST00000622768 5173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TP63-211ENST00000449992 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CRYGA-201ENST00000304502 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL136981.1-201ENST00000411450 549 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC023137.1-201ENST00000448241 308 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPL23AP96-201ENST00000514593 591 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC138466.2-201ENST00000540993 304 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 SCAND2P-204ENST00000541103 669 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC055716.3-201ENST00000547533 761 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TRMT112P7-201ENST00000603133 367 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 LINC01588-217ENST00000635379 1595 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC005722.2-201ENST00000577087 3370 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 KCNH5-204ENST00000420622 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC246817.2-201ENST00000523971 577 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 LINC01444-202ENST00000581211 654 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CACNB1Q02641 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms