Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPRBP23467 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms