Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MT-TS1-201ENST00000387416 69 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MIR1269A-201ENST00000408636 105 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL355149.1-201ENST00000438396 882 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC092431.2-201ENST00000441658 318 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC004257.1-201ENST00000593588 277 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TCF4-241ENST00000568740 2628 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SLC24A2-201ENST00000286344 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TMEM97P1-201ENST00000452969 451 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms