Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CEP290O15078 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CEP290O15078 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CEP290O15078 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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