Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms