Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms