Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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LRRC38Q5VT99 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRC38Q5VT99 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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