Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
FXNQ16595 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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FXNQ16595 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FXNQ16595 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FXNQ16595 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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FXNQ16595 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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FXNQ16595 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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