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| FHL3 | Q13643 | ZNF224-201 | ENST00000336976 | 3980 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
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| FHL3 | Q13643 | OR52I2-203 | ENST00000641896 | 6591 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | DZIP3-201 | ENST00000361582 | 5350 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC242426.1-201 | ENST00000435270 | 960 nt | BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | REREP2Y-201 | ENST00000439103 | 200 nt | BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
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| FHL3 | Q13643 | KRTAP2-5P-201 | ENST00000446109 | 396 nt | BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC002383.1-201 | ENST00000448260 | 671 nt | TSL 5 BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC002553.3-201 | ENST00000453002 | 341 nt | BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | RANP2-201 | ENST00000456833 | 229 nt | BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |
| FHL3 | Q13643 | B4GALT4-AS1-201 | ENST00000470790 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 4.78 | □□□□□ -1.64 | | |