Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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