Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ITGB3BPQ13352 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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ITGB3BPQ13352 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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