Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SP140Q13342 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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