Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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