Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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FOXC1Q12948 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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