Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PGGT1BP53609 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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