Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CASQ1P31415 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CASQ1P31415 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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CASQ1P31415 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CASQ1P31415 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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